Le Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM) EA4312 de l’Université de Rouen est issu de l’évolution d’une équipe de Microbiologie qui a été crée par le Pr. N. Orange en 1986 lors de l’ouverture du Département de Génie Biologique sur Evreux. D’abord Equipe puis Laboratoire de Microbiologie du Froid (EA2123), en 2007 l’unité était labellisée EA4312 sous le nom de Laboratoire de Microbiologie du Froid-Signaux et Micro-Environnement (LMDF-SME). Le Pr. Orange ayant été nommée Vice-Présidente de l’Université de Rouen, en 2008 le Pr. M. Feuilloley était nommé directeur du LMDF-SME. En 2010 l’unité était renouvelée EA4312 sous le nom de Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM) avec la note A sur les 4 points clefs de l’AERES.
Rôle de la communication et des facteurs environnementaux ou eucaryotes dans l’adaptation et la virulence bactérienne.
La thématique de recherche du LMSM est la suivante :
Rôle de la communication et des facteurs environnementaux ou eucaryotes dans l’adaptation et la virulence bactérienne.
Numerous projects carried out by the LMSM are co-financed by the European Union with the European regional development fund (ERDF).
Au 30 juin 2015, l’effectif du LMSM est de 34 membres (hors Post-Doctorants, Doctorants et Stagiaires de niveaux L et M) dont 5 PR, 5 MCF-HDR, 2 PR-Emérite, 5 MCF non HDR, 10 BIATSS (dont 6 sur postes fixes), 2 Chercheurs mis à disposition par un partenaire privé et 3 Membres Associés PRAG. Un Ingénieur de Recherche en CDD sur 18 mois (poste fixe à pourvoir en 2016).
Lecteurs de Microplaques Multimodaux ; Microcosmes ; Station d’Anaerobiose;
Tensiomètre Thermostaté; Laboratoires de Sécurité Microbiologique L2 et L3; Nanodrop ;
Appareil de Q-PCR ; Ultra-Centrifugeuse 100Kg; Cryocongélateur -140°C
et Souchier informatisé; Spectromètre de masse MALDI-TOF/TOF
(Logiciel d’identification Biotyper®, Protéomique, lipidomique)
Appareil de Résonance Plasmonique de Surface (SPR); Robot Spotter ;
Spectromètre de masse MALDI-TOF/TOF (Couplage SPR/MALDI); Serveur de
Modélisation 3D
Microscope Confocal à Balayage Laser; Spectromètre de masse MALDI-TOF/TOF
(Imagerie MALDI); Séquenceur ADN; Mesure de Résistance trans-épitheliale;
Modèles de Toxicité In-Vitro (HaCat, Caco2, A547, C. elegans, D. discoideum,
Peau humaine reconstruite); Sensibilisation; Biocompatibilité ; ICC

Séquenceur de 2e génération Illumina Miseq ; fluorimètre QuBit 4
Les bactéries sont capables de percevoir tous types de signaux émanant de leur microenvironnement, qu’ils soient de nature physique, chimique ou biologique grâce à la présence de nombreux senseurs (récepteurs). Ces senseurs sont associés à des systèmes de transmission et/ou transduction de ces signaux qui vont les amener jusqu’au niveau du cytoplasme où auront lieu des régulations génétiques conduisant à la production d’effecteurs nécessaires à l’adaptation de la bactérie à son environnement, à l’expression de sa virulence, et à la formation de biofilms.
Le microbiote humain, estimé à 1014 micro-organismes, se répartit en différentes niches environnementales dont l’intestin et la peau, mais aussi les voies aériennes supérieures. La densité du microbiote intestinal humain, estimé à 1011-1012 germes par ml de fluide intestinal, est le plus important par sa taille, menant à un nombre 10 fois supérieur à celui des cellules eucaryotes du corps humain. Sa diversité serait de 500 à 1000 espèces bactériennes issues de 7 des 55 phyla connus. Le microbiote cutané, tout aussi diversifié mais moins bien connu, représente le second microbiote humain. En termes de gènes et fonctions, à un temps donné ce microbiote exprimerait 100 à 400 fois plus de gènes que l’ensemble des cellules eucaryotes du corps humains et est donc considéré comme un second génome. Il apparait aujourd’hui que les microbiotes intestinaux et cutanés sont étroitement interconnectés et que, même au niveau respiratoire, la réaction physiologique de l’hôte peut être influencée par des signaux exogènes (e.g. polluants atmosphériques, cosmétiques…) et endogènes (e.g. cytokines, hormones, neurohormones …) qui ne sont pas localisés à ce seul compartiment. Dans certains cas, l’interaction bactérie-cellule humaine est assurée au travers d’organes bactériens dédiés à cette fonction (systèmes de sécrétion) grâce auxquels sont transmis à l’hôte des effecteurs.
La densité racinaire du microbiote végétal est usuellement estimée à 108-109 microbes par gramme de sol rhizosphérique, et peut atteindre jusqu’à 1010-1011 microbes par gramme à la surface des surfaces matures exsudantes (rhizoplan). Sa diversité serait supérieure à 30 000 espèces bactériennes. Le génome collectif de cette communauté est donc bien plus grand que celui de la plante et, tout comme le microbiote humain, est lui aussi considéré comme le second génome de l’hôte eucaryote. A cause de cette forte diversité et des rejets anthropiques, le microbiote végétal héberge aussi des isolats appartenant aux espèces pathogènes humaines opportunistes ou non.
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CRÉPIN A, BARBEY C, DIALLO S, ORANGE N, FEUILLOLEY M, DEVEAUX V, BURINI J-F, LATOUR X. La rhizosphère de la pomme de terre comme modèle pour le développement de nouvelles méthodes de lutte biologique. 10èmes Rencontres Plantes-Bactéries – Aussois 2012, 30 janvier – 03 février 2012
DAGORN A, CHAPALAIN A, LESOUHAITIER O, POC C, VIEILLARD J, CHEVALIER S, TAUPIN L, LE DERF F, ORANGE N, FEUILLOLEY MGJ. Extracellular gamma aminobutyric acid (GABA) regulates Pseudomonas virulence. Journée de l’EdNBISE, Rouen, 23 mars 2012
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MCCARTHY R., MOOIJ M., LESOUHAITIER O., NECKERMANN G., NOONAN B., O’GARA F. Novel LTTR plays a key role in biofilm formation and pathogenicity in P. aeruginosa. 35th European CF Conference, Dublin (Ireland) 6-9 June 2012
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NICORESCU, I., NGUYEN, B., CHEVALIER, S., ORANGE, N. Spices decontamination by a pulsed light treatment. Impact on their quality and organoleptic properties, Effost, Montpellier (France), 20-23 Novembre 2012
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DAGORN A, CHAPALAIN A, LESOUHAITIER O, POC C, VIEILLARD J, CHEVALIER S, TAUPIN L, LE DERF F, ORANGE N, FEUILLOLEY MGJ. Extracellular gamma aminobutyric acid (GABA) regulates Pseudomonas virulence. Journée de l’EdNBISE, Rouen, 23 mars 2012
MIJOUIN L, HILLION M, JAOUEN T, BARREAU M, YVERGNAULT F, FEUILLOLEY M. Influence of cosmetic compounds on the inflammatory effect of skin bacteria. Journée de l’EdNBISE, Rouen, 23 mars 2012
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LENEVEU C, BOUFFARTIGUES E., FEUILLOLEY MGJ, CONNIL N, CHEVALIER S. Involvement of the protein TSPO in Pseudomonas fluorescens adaptation to the environnement. Journée de l’EdNBISE, Rouen, 23 mars 2012
HILLION M, JAOUEN T, ROSAY T, BOIREAU W,ZEGGARI R, SIMON B, BLIER AS, FEUILLOLEY M, LESOUHAITIER O. Surface Plasmonic Resonance (SPR) and MALDI-TOF-TOF coupling strategy to identify bacterial natriuretic peptides protein sensor. Label Free Technogies Advances and Applications, Amsterdam, 1-3 nov 2012
BRISSET F, VIEILLARD J, MORIN-GROGNET S, JAOUEN T, LESOUHAITIER O, FEUILLOLEY M, LE DERF F. Efficient linking strategy on gold and polymers surfaces to have biological sensors on-demand. Label Free Technogies Advances and Applications, Amsterdam, 1-3 nov 2012
HILLION M, MIJOUIN L, DAGORN A, ROSAY T, MADI A, JAOUEN T, CONNIL N, POC C, GROBOILLOT A, LESOUHAITIER O, ORANGE N, CHEVALIER S, FEUILLOLEY MGJ. Pseudomonas fluorescens, a member of the gut-brain-skin axis. Colloque IRIB2012, Rouen, 1 juin 2012
ROSAY T, JAOUEN T, HILLION M, MIJOUIN L, BLIER AS, ORANGE N, VIEILLARD J, LE DERF F, FEUILLOLEY MGJ, LESOUHAITIER O. Les peptides natriuretiques, une famille d’hormones mammifères, qui stimulent la virulence bactérienne. Colloque IRIB2012, Rouen, 1 juin 2012
MADI A, AL-NABHANI Z, LENEVEU C, FEUILLOLEY M, CONNIL N. Human b-defensin-2 modulates virulence of Pseudomonas fluorescens on caco-2/TC7 cells. Colloque IRIB2012, Rouen, 1 juin 2012
ROSAY T, HILLION M, BEN MLOUKA MA, HARDOUIN J, COSETTE P, JAOUEN T, FEUILLOLEY M, LESOUHAITIER O. Effect of natriuretic peptides, a mammalian hormone, on whole bacterial Pseudomonas aeruginosa proteomic expression through nanoLC-ESI-MS/MS approach. Congrès de la Société Française d’Electrophorèse et d’Analyse Protéomique (SFEAP), Rouen, 15-17 octobre 2012
GICQUEL G, BOUFFARTIGUES E., BAINS M., OXARAN V., LESOUHAITIER O., CONNIL N., BAZIRE A., MAILLOT O., BENARD M., CORNELIS P., HANCOCK REW, DUFOUR A., FEUILLOLEY MGJ, ORANGE N., DEZIEL E., CHEVALIER S. Le facteur sigma à fonction extracytoplasmique SigX module des propriétés liées à la virulence chez Pseudomonas aeruginosa. colloque des GRR 2012, Rouen, France 29-30 Novembre 2012
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FITO-BONCOMPTE L., BOUFFARTIGUES E., VERON W., LESOUHAITIER O., ORANGE N., FEUILLOLEY M., CHEVALIER S. Full virulence of pseudomonas aeruginosa requires Oprf. 17ème Journée Scientifique de l’IFRMP23, Mont-Saint-Aignan, 17 juin 2011
Aout 2022:
Louis et coll viennent de publier en Septembre 2022 un article dans le journal Microorganisms :
Louis M, Tahrioui A, Verdon J, David A, Rodrigues S, Barreau M, Manac’h M, Thiroux A, Luton B, Dupont C, Le Calvé M, Bazire A, Crépin A, Clabaut M, Portier E, Taupin L, Defontaine F, Clamens T, Bouffartigues E, Cornelis P, Feuilloley MGJ, Caillon J, Dufour A, Berjeaud JM, Lesouhaitier O, Chevalier S (2022) Effect of phthalates and their substitutes on the physiology of Pseudomonas aeruginosa. Microorganisms 2022, 10
Aout 2022:
Tortuel et coll viennent de publier en Aout 2022 un article dans le journal Microbiol Spectr.
Tortuel D, Tahrioui A, David A, Cambronel M, Nilly F, Clamens T, Maillot O, Barreau M, Feuilloley M, Lesouhaitier O, Filloux A, Bouffartigues E, Cornelis P, Chevalier S (2022) Pf4 phage variant infection reduces virulence-associated traits in Pseudomonas aeruginosa. Microbiol. Spectr. 29:e0154822.
Janvier 2022:
Mélissande Louis et coll viennent de publier en Janvier 2022 un article dans le journal Advanced Science.
Louis M, Clamens T, Tahrioui A, Desriac F, Rodrigues S, Rosay T, Harmer N, Diaz S, Barreau M, Racine PJ, Kipnis E, Grandjean T, Vieillard J, Bouffartigues E, Cornelis P, Chevalier S, Feuilloley MGJ, Lesouhaitier O (2022) Pseudomonas aeruginosa Biofilm Dispersion by the Human Atrial Natriuretic Peptide. Adv. Sci. 9(7):e2103262. doi: 10.1002/advs.202103262
Le 12 juillet 2021, Monsieur Yoan KONTO-GHIORGHI a soutenu son HDR intitulée « Interactions Cellules ‐ Microenvironnement », réalisée au LMSM, Université de Rouen Normandie, Evreux.
Le 7 juillet 2021, Madame Mathilde Bouteiller a soutenu sa thèse, réalisée au LMSM, Université de Rouen Normandie, Evreux.
Le 9 juin 2021, Monsieur Maximilien Clabaut soutiendra sa thèse intitulée: « Effet de l’hormone stéroïdienne 17β-estradiol sur deux souches de Lactobacillus crispatus, marqueur de l’homéostasie vaginale » réalisée au LMSM à Evreux, Université de Rouen Normandie.
Le 17 et le 18 mai 2021 se sont tenues les 23èmes journées de l’Ecole Doctorale Normande de Biologie Intégrative, Santé et Environnement (EDnBISE). Ce colloque de deux jours a été organisé en grande partie par des doctorants du LMSM a rassemblé environ 90 doctorants normands qui ont pu présenter leurs travaux sur des thématiques variées.
Le mardi 06 avril 2021 s’est tenu une demi-journée scientifique organisée dans le cadre d’échange scientifique entre les 2 laboratoires LMSM et U2RM.
Durant cet demi-jourée,11 communications orales se sont succédées couvrant les champs de recherche des deux laboratoires.
Mars 2021:
Mohamed Zommiti et Mounir Ferchichi viennent de publier un chapitre intitulé « Probiotics and prebiotics in animal feed » qui est éditer dans le livre « Probiotics and prebiotics in food ».
Probiotics and Prebiotics in Foods; Challenges, Innovations, and Advances; 2021, Pages 233-261
Mars 2021:
Maximilien Clabaut et coll viennent de publier en Mars 2021 un article dans le journal Scientific Reports.
Clabaut M, Suet A, Racine PJ, Tahrioui A, Verdon J, Barreau M, Maillot O, Le Tirant A, Karsybayeva M, Kremser C, Redziniak G, Duclairoir-Poc C, Pichon C, Chevalier S, Feuilloley MGJ. Effect of 17β-estradiol on a human vaginal Lactobacillus crispatus strain. Sci Rep. 2021 Mar 30;11(1):7133. doi: 10.1038/s41598-021-86628-x.
Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement – LMSM – EA4312
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